技術支持
致力于引進國外先進技術,為廣大科研工作者和醫(yī)療機構提供高質量 的科研技術支持 。
PCR產物經克隆后測序發(fā)現,引物處的堿基有錯誤,怎么辦?
A15:因為引物純度不可能是100%,因此,挑選克隆時,有可能挑選了雜質引物擴增出的PCR產物的克隆。此時,請重新挑選一個克隆測序,會得到正確的結果。如果挑選2 ~ 3個克隆測序情況還沒改觀,我們會免費重新合成引物并以最快的速度送到您的手里。如進行索賠時,按國際行業(yè)慣例,索賠范圍限于制品價格范圍之內。
能否根據引物電泳后EB染色后條帶的亮度對合成的引物進行定量?
A14:不能。因為EB是通過嵌入到核酸的雙螺旋間而使其著色的。合成的DNA分子為單鏈,只有通過自身回折形成局部發(fā)夾環(huán)結構或鏈間形成部分雙螺旋結構,才能被EB染色。由于不同引物的序列不同,形成雙螺旋的能力不同,因此染色能力不盡相同,也就不能根據EB染色帶的亮度來對合成的DNA進行定量。
合成的引物進行PCR反應時無目的條帶,如何解釋?
PCR反應失敗的原因很多,可以從以下幾個方面考慮:引物和模板是否配對,同源性有多大;引物本身是否有立體結構;PCR反應用試劑是否能正常工作;PCR儀是否工作正常;PCR反應條件是否合適;如果一切正常,還無法解決問題時,我們可以免費重新合成引物。
使用3%Agarose凝膠電泳分析合成的引物,發(fā)現有很多條泳帶?
對引物進行電泳一定要使用變性PAGE電泳。由于引物是單鏈DNA,容易形成復雜的立體結構,因此進行Agarose電泳時,容易出現多條泳帶,更無法用Agarose電泳進行定量了。
測定了引物的OD值后發(fā)現A260/A280<1.8,引物純度合格嗎?
由于核酸在260nm附近有強吸收,而蛋白質在280nm附近有強吸收,從生物體內提取核酸時,常用A260/A280比值來評價核酸純度(比值在1.8~2.0之間),這一判斷是基于序列中A、G、C、T所占比例大致相同時的結果。而合成的DNA/RNA則不同,序列很短 (通常在20~30個堿基之間),其中A、G、C、T各種堿基所占比例很不相同,由于各種堿基的摩爾消光系數不同,因此不同堿基構成的引物的A260/A280比值也不同,例如當序列中C、T堿基的含量高時,該比值會大大低于1.8。所以不能用A260/A280的比值來判斷引物的純度。
一般合成的引物末端有磷酸基團嗎?
沒有,5和3末端均為-OH基。如需要加磷酸基團,則需要使用修飾合成增加磷酸化。
如何檢測引物的純度?
實驗室方便的作法是用PAGE方法。使用加有7M尿素的一定濃度的聚丙烯酰胺凝膠進行電泳,<12個堿基的引物用20%的膠,12-60個堿基的引物用16%的膠,>60個堿基的引物用12%的膠,取0.2OD左右的引物,用尿素飽和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到飽和,上樣前加熱變性(95oC,2mins)。加入尿素的目的一是變性,二是增加樣品比重,容易加樣。600V電壓進行電泳,一定時間后(約2-3小時),剝膠,用熒光TLC板在紫外燈下檢測帶型,在主帶之下沒有雜帶,說明純度是好的(有時由于變性不充分,主帶之上可能會有條帶,乃是引物二級結構條帶)。
為何長鏈引物的合成費用比短鏈引物的要高?
通常在合成長鏈引物時,試劑的加入量要比短鏈引物多很多,尤其是大于90bp以上的引物,由于成本的增加,從而導致價格也要增加。
艾基生物可以為您合成多長的序列?
150堿基以下。
如何計算oligo的摩爾數?
1個OD值的Oligo的重量約為33 μg,而每個堿基的平均分子量一般按330道爾頓進行計算。因此, 合成oligo的nmol數一般按以下公式粗略地計算: nmole數=(OD值x33μg)/(堿基數x330)x1000=OD值/堿基數x100如果需要計算合成DNA的精確濃度,請按以下公式進行計算: nmole數=(OD值x1000)/[ (15.3xA#)+(7.4xC#)+(11.8xG#)+(9.3xT#) ]
oligo如何定量?
用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量,測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2-0.8之間(吸光度太高或太低會有較大的誤差)。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,取部分溶液稀釋到1ml并在1ml標準比色皿中測定其吸光度,即為所測體積的OD值,進而可以計算出母液的OD值。
oligo如何保存?
沒有溶解的引物非常穩(wěn)定,可以在-20℃下保存至少1年,溶解好的引物可以事先稀釋為100μmoL/L的儲存液,分裝數管保存于-20℃冰箱,可以保存至少半年以上(反復多次凍融會降低使用壽命)。使用前,將濃溶液稀釋成工作液后進行實驗。
oligo如何溶解?
我們的合成報告單給出了每OD引物稀釋為100μmoL/L(即100pmol/ul)濃度的加水量,您可以根椐您的實驗需要加入適量的無核酸酶的雙蒸水(PH>6.0)或TE緩沖液(PH 7.5-8.0),開啟瓶蓋溶解之前最好在3000-4000轉/分鐘的轉速下離心1分鐘,防止開蓋時引物散失。
艾基引物純化方式?
純化方式 詳細說明 C18 柱脫鹽 又稱為簡易反相柱,對DNA 有特異性吸附,可被有機溶液洗脫,但不會被水洗脫,因此能有效地去除鹽分。 R-PAGE 基于特異或反向層析法, 從合成好的產物中去除失敗序列,適于35 個堿基以下的引物。 PAGE 純化 PAGE 純化法是使用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,對引物DNA 進行分離,然后從凝膠中回收目的DNA。 HPLC 純化 HPLC 純化是使用高效液相色譜的原理,對引物DNA 進行純化。該方法用于分離純化或分析時能達到很高的純度和靈敏度。常用的有離子交換HPLC 和反相HPLC。
引物是如何合成的?
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種,無論采用什么機器合成,合成的原理都相同,主要差別在于合成產率的高低,試劑消耗量的不同和單個循環(huán)用時的多少。(1) 去保護:加入Deblocking脫去堿基上5'- OH的保護基團 DMT ,獲得游離的 5'- OH;(2) 耦合:同時加入活化劑和新的堿基,新的堿基 5'- OH仍然被 DMT 保護,3' 端被活化與溶液中游離的 5'- OH發(fā)生耦合反應;(3) 封閉:耦合反應中極少數 5'- OH沒有參加反應 ,用封閉試劑終止其后繼續(xù)發(fā)生反應;(4) 氧化:加入氧化劑使其由核苷亞磷酸酯形成更穩(wěn)定的核苷磷酸酯。合成后處理:切割與脫保護基:將合成好的寡核苷酸…